孙昌龄，真州（今江苏仪征）人，一作晋陵（今江苏常州）人（《续资治通鑑长编》卷三九一）。神宗熙宁七年（一○七四），知通州。元丰初，知江宁府（同上书卷二五八）。六年（一○八三），改两浙转运副使（同上书卷三七三）。哲宗元祐元年（一○八六），知福州（《苏轼文集》卷三八《两浙转运副使孙昌龄可秘阁校理知福州》），以其亲老，移苏州（《续资治通鑑长编》卷三九一）。