本书在宋《嘉祐本草》基础上予以扩充、调整，并入《本草图经》而成。前两卷为序例，卷一增“雷公炮炙论序”，卷二诸病通用药部分增补若干药名与病名；后二十九卷载药一千七百四十八种，分玉石、草、木、人、兽、禽、虫鱼、果、米谷、菜等部，以及有名未用、《本经》和《图经》外药等。每药首列药图，次为《嘉祐本草》文，再次为《图经》文，最后为增补内容，冠以墨盖子以示区别，主要为“雷公曰”、附方等。本书资料丰富，除引录《嘉祐本草》、《本草图经》全部内容外，又搜罗了本草、方书、经史、笔记、地志、诗赋、佛书、道藏等二百四十三种书籍中有关药物资料，保存了大量现已散佚的文献内容，增添《嘉祐本草》未收药物四百七十余种，其中包括历代本草所载而被遗漏者及本书增添的八种。在阐述药名、药性、功能、主治、形态、采收等内容以外，进一步阐明药物归经理论；补入二百八十多种药物的炮制方法；收载附方三千余首、方论一千余条，突出了以方证药；另将药图收入，图文并茂，有按图索骥之便。在编写过程中体例严谨，分类系统，药物内容层次分明，先后有序；又创用墨盖子作为增补内容标记，采用大字标出处、小字写注文或用文字说明等法，清晰地展现了历代本草发展脉络。